Explorando las formas de la naturaleza: Donald Ingber

http://www.youtube.com/watch?v=AT5fsO95-qg

Guía para la discusión del viernes 23 de abril

1) El artículo reúne conceptos de modelación matemática, geometría, arquitectura y biología. Analice la organización de una estructura geodésica y sus usos en arquitectura. Busque información sobre Buckminster Fuller.

2) ¿Qué componentes de la célula representan los elementos más evidentes de un modelo de integridad tensional?

3) ¿Qué papel cumple el sustrato sobre el que se asienta una célula en relación a su forma y funcionalidad? ¿Qué mensaje recibe y ejecuta esa célula integrante de un tejido?

4) Existen ejemplos de ensamblaje según el modelo de tensegridad desde las moléculas a los organismos. Analícelos desde el punto de vista evolutivo.

Integridad tensional...Wikipedia y la NASA

Tensegridad es un término arquitectónico acuñado por Buckminster Fuller como contracción de tensional integrity (integridad tensional). La tensegridad se define como la característica que exhiben determinadas estructuras, cuya estabilidad depende del equilibrio entre fuerzas de tracción y compresión. 
http://es.wikipedia.org/wiki/Tensegridad

Junio 19, 2002: La obra "Torre de Agujas" del escultor Kenneth Snelson parece frágil. Varillas entrecruzadas suspendidas por tensos alambres, se alzan peligrosamente hasta una altura de 20 metros. Parecería que la estructura se va a derrumbar o caer de costado. Sin embargo esto no sucede. Cuando sopla el viento, la Torre de Agujas se dobla, pero no se rompe. Cuando alguien le da un empujón, regresa a su sitio. La torre es liviana, resistente y de una sutil hermosura.

Igual que los esqueletos de las células. http://ciencia.nasa.gov/headlines/y2002/19jun_cytoskeletons.htm

 

GUÍA PARA LA LECTURA LA CLAVE GENÉTICA III CRICK, 1966

1. ¿Qué estrategia utilizaron Nirenberg y Leder para descifrar la mayoría de los codones del código genético?

2. ¿En qué consiste la hipótesis de balanceo y qué significado biológico puede tener?

3. ¿Qué consecuencia puede tener en la proteína resultante los siguientes cambios en la secuencia de ADN que la codifica:

a. Una sustitución de un nucléotido por otro.

b. Una inserción de un nucleótido.

c. Una inserción de un nucleótido y una deleción de un nucleótido.

d. Tres inserciones.

4. ¿De qué manera el conocimiento de una secuencia aminoacídica (por ejemplo la beta globina de la hemoglobina) y de la misma secuencia con una alteración en un solo aminoácido, ayudó a la confirmación de la atribución de tripletes a cada aminoácido? (Es el caso del cambio de ácido glutámico por valina en la hemoglobina y pueden ayudarse con el código).

Preguntas de guía para la segunda instancia de discusión

GUÍA LECTURA FUENTES ABISALES – ENTREVISTA MILLER
1.¿Qué plantea la teoría de Oparín, sobre las condiciones que presentaba la Tierra primitiva, capaces de generar la evolución prebiótica?
2.¿ Qué objeciones presentan a esta teoría, los autores en el presente artículo?
3.¿ En base a qué resultados discuten estas objeciones?
4.Describa los principales experimentos que realizó Miller en la década del ’50.
5.¿Qué aporte original hay en el diseño de estos experimentos, en relación a otros que se realizaron, por diferentes investigadores, en la misma época?
6.¿Qué representan los experimentos de Miller para la Teoría de Oparín?

¿Qué dice Wikipedia en relación al origen de la vida?

• Origen de la vida http://es.wikipedia.org/wiki/Origen_de_la_vida
• Biografía de Aleksandr oparin http://es.wikipedia.org/wiki/Aleksandr_Oparin
• Experimento de Miller y Urey http://es.wikipedia.org/wiki/Experimento_de_Miller_y_Urey 

¿La Molécula Más Primigenia de la Maquinaria de la Vida?

http://www.amazings.com/ciencia/noticias/020410e.html?utm_source=feedburner&utm_medium=feed&utm_campaign=Feed:%20NoticiasDeLaCienciaYLaTecnologia%20(Noticias%20de%20la%20Ciencia%20y%20la%20Tecnologia)&utm_content=Google%20Reader


Una molécula de ARN muy pequeña creada por un equipo de científicos puede catalizar una reacción clave necesaria para sintetizar proteínas, los "ladrillos" fundamentales de la vida.

Este logro podría constituir un avance sustancial hacia el conocimiento definitivo de los orígenes de la vida en la Tierra.

Esta enzima, la enzima de ARN más pequeña conocida que realiza una reacción química celular, ha sido creada en la Universidad de Colorado en Boulder.

Rebecca Turk, Nataliya Chumachenko y Michael Yarus han intervenido en este trabajo.

El ARN celular puede tener cientos o miles de sus unidades estructurales básicas, llamadas nucleótidos. El equipo de Yarus se concentró en una ribozima (una forma de ARN que puede catalizar reacciones químicas) que tiene sólo cinco nucleótidos.

Charla sobre monitoreo participativo en pesca artesanal

El próximo martes 14 de abril habrá una presentación interesante sobre el uso de artes de pesca alternativos para disminuir el impacto sobre las comunidades costeras... un ejemplo más de trabajos que se están realizando en Uruguay que contribuyen a la conservación de la biodiversidad

“DISEÑO, CONSTRUCCIÓN Y MONITOREO PARTICIPATIVO DE ARTES DE PESCA SELECTIVAS: LA PESQUERÍA ARTESANAL DE LANGOSTINO EN PUNTA DEL DIABLO-ROCHA.”
Angel Segura y Fabrizio Scarabino
http://robinpuntadeldiablo.blogspot.com/

Se presentará el miercoles 14 de Abril a las 13:30 en el salon de Seminarios II (Facultad de Ciencias; Igua 4225 esq. Mataojo) un resumen de las actividades desarrolladas y los principales resultados obtenidos en el marco del proyecto. El mismo fue ejecutado por la organización civil Investigación y Desarrollo (I+D) y financiado por el PPD/GEF/PNUD.

Resumen ejecutivo
Las pesquerías artesanales constituyen un cuarto de la producción pesquera total mundial y capturan más de la mitad del pescado consumido directamente por los humanos. Sin embargo reciben poca o nula atención por parte de las autoridades nacionales y son poco consideradas al establecer pautas para su uso sustentable. En particular, las pesquerías de camarones utilizan como arte de pesca una red de arrastre de fondo con baja selectividad, lo que genera la captura incidental de otras especies también de importancia comercial. En algunos casos, esta captura incidental puede llegar a ser mayor que la captura de la propia especie objetivo lo cual es considerado mundialmente una amenaza a la biodiversidad marina.
El objetivo de este proyecto fue disminuir el impacto de la pesquería artesanal de Pleoticus muelleri sobre la fauna acompañante, mediante el diseño, construcción e instalación de un dispositivo excluidor de peces juveniles (DEPJ) en las redes de pesca artesanal y la transferencia de dicha tecnología a la comunidad de pescadores de Punta del Diablo. Además, en el proceso de la investigación se realizó un importante relevamiento de la diversidad de peces e invertebrados marinos.

Seminario sobre Biodiversidad en Piriápolis

Biodiversidad en Piriápolishttp://www.cebra.com.uy/presponsable/

Los próximos 15 a 17 de abril de 2010 se realizará un Seminario sobre “Conservación y uso sostenible de la Biodiversidad” en la ciudad de Piriápolis. El evento nucleará a 400 productores y técnicos que están trabajando en temas relacionados a la investigación, conservación y uso sostenible de la biodiversidad.

Las inscripciones se encuentran abiertas en este sitio web cobrándose solamente parte de los costos.

De otros grupos de discusión nos llega información...

Abajo va una nota que encontró Valentina Franco sobre chimeneas hidrotermales que puede ser un buen complemento para la segunda lectura

Chimeneas hidrotermales de la Ciudad Perdida:
Una noche de diciembre del año 2000, mientras el buque de investigación Atlantis surcaba el Atlántico remolcando una cámara a unos 700 metros de profundidad, la geóloga Debbie Kelley y sus colegas descubrieron una chimenea blanca como la nieve que parecía brillar de tan caliente. Al explorar desde un sumergible, el quipo halló un "bosque" de agujas, una de ellas de 60 metros de altura. Aquel lugar, que bautizaron con el nombre de Ciudad Perdida [Lost City], es un campo de chimeneas hidrotermales de un tipo totalmente nuevo, donde las bocas activas expulsan agua a temperaturas relativamente bajas, entre 40 y 75ºC, resultado de una reacción química etre el agua y una roca subcortical llamada peridotita. Cuando la solución alcalina emerge, precipita carbonato cálcico, que forma unas estructuras semejantes a las estalagmitas. Antes del hallazgo de la Ciudad Perdida, casi todas las chimeneas submarinas conocidas se encontraban en regiones de formación reciente y volcánicamente activas, como las dorsales mediooceánicas, donde el agua que mana de las chimeneas sulfurosas puede alcanzar temperaturas de hasta 405ºC. Pero las formaciones de la Ciudad Perdida se encuentran a 15 kilómetros de la dorsal medioatlántica, sobre un suelo oceánico de 1,5 millones de años de antigüedad, en un ambiente alcalino que podría ser similar al de la Tierra primigenia. (R.A.Lutz)

En los años ochenta se logró sacar a la superficie sérpulas gigantes, provenientes de las proximidades de chimeneas volcánicas submarinas. Asimismo, se descubrieron nuevas especies de mejillones en las filtraciones de metano del fondo del Golfo de México, en el tejido de cuyas branquias fueron halladas bacterias simbióticas metabolizadoras de dicho gas. Con gran frecuencia se descubren nuevos animales, plantas y microbios submarinos, mientras que un creciente número de de estudios demuestra el valor potencial de los organismos marinos ya conocidos, muchos de los cuales producen sustancias imposibles de encontrar en tierra firme. Cada hallazgo ofrece la oportunidad de descubrir nuevos materiales y técnicas. Una mejor comprensión del modo como construyen sus cáscaras los crustáceos, por ejemplo, ha ayudado a los científicos a desarrollar finos recubrimientos cerámicos, de aplicación ya corriente en la fabricación de motores de automóvil e instrumental clínico. Esos descubrimientos tienen a veces importantes consecuencias: un compuesto extraído de una esponja del Pacífico ha permitido desarrollar más de 300 análogos (compuestos químicos similares), muchos de los cuales están siendo probados como agentes antiinflamatorios. (Eric S.Grace)

En la cadena alimenticia bentónica son importantes las bacterias de los sedimentos. Suelen encontrarse donde hay grandes cantidades de materia orgánica. El conjunto de todas las bacterias en un metro cuadrado en la capa superior del limo puede llegar a pesar varias décimas de gramo. Las bacterias sintetizan proteínas de los nutrientes disueltos y, a su vez, se transforman en fuente de proteínas, grasas y aceites para otros organismos.

En 1977, los oceanógrafos descubrieron por primera vez las chimeneas hidrotermales de altas temperaturas situadas en aguas profundas a lo largo de las crestas volcánicas del suelo del océano Pacífico cerca de las islas Galápagos. Estas chimemneas arrojan chorros de líquidos supercalientes que calientan el agua circundante entre 8ºC y 16ºC, considerablemente superior a los 2ºC de temperatura ambiente. Desde entonces, los oceanógrafos han descubierto chimeneas similares en otras colinas volcánicas a lo largo de centros de rápida expansión del suelo oceánico, particularmente en el Atlántico medio y en el Pacífico oriental. Las chimeneas se forman cuando el agua marina fría fluye hacia abajo a través de las fisurasy hendiduras del suelo de lava basáltica en la profundidad de la corteza subyacente. Las aguas reaccionan químicamente con el basalto caliente, entregando algunos minerales pero enriqueciéndose con otros como el cobre, hierro, azufre y zinc. El agua, calentada a alta temperatura, vuelve a surgir a través de chimeneas mineralizadas elevándose a 13 metros por encima del suelo marino. Entre las chimeneas hay fumarolas blancas y negras. Las fumarolas blancas ricas en sulfuros de zinc emiten un fluido lechoso a 300ºC. Las fumarolas negras, chimeneas más angostas ricas en sulfatos de cobre, emiten chorros de aguas claras a 300ºC o más de 450ºC que rápidamente se vuelven negras por precipitación de partículas de minerales de azufre de grano fino. Asociada con estas chimeneas hay una rica diversidad de vida única en las profundidades del mar limitada a unos pocos metros del sistema de chimeneas. Los principales productores son bacterias quimiosintéticas que oxidan los compuestos de azufre reducidos como H2S para liberar la energía usada y formar materia orgánica a partir del dióxido de carbono. Los consumidores primarios incluyen a las almejas gigantes, los mejillones y los gusanos poliquetos que filtran bacterias del agua y se alimentan de las películas bacterianas de las rocas.